Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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