Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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