Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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