Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3B2Q13435 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
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