Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN3Q13286 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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