Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ERCC8Q13216 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ERCC8Q13216 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ERCC8Q13216 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ERCC8Q13216 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ERCC8Q13216 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ERCC8Q13216 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ERCC8Q13216 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ERCC8Q13216 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ERCC8Q13216 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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