Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1BQ13112 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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