Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN3Q13064 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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