Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECH1Q13011 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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