Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms