Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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