Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2Q12800 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms