Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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GTF3C1Q12789 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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GTF3C1Q12789 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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GTF3C1Q12789 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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GTF3C1Q12789 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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GTF3C1Q12789 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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GTF3C1Q12789 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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