Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms