Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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