Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms