Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms