Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms