Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms