Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GCNT1Q02742 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms