Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms