Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN2Q02246 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms