Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1DQ01668 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms