Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RELBQ01201 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RELBQ01201 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RELBQ01201 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms