Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms