Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLTCQ00610 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms