Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNA1P78396 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms