Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTG1P63261 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTG1P63261 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTG1P63261 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTG1P63261 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTG1P63261 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTG1P63261 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms