Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11AP62491 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB11AP62491 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms