Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERV-K104P61576 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERV-K104P61576 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERV-K104P61576 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERV-K104P61576 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERV-K104P61576 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERV-K104P61576 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERV-K104P61576 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HERV-K104P61576 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERV-K104P61576 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms