Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SPCS3P61009 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPCS3P61009 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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SPCS3P61009 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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