Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP25P60880 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms