Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00313P59037 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00313P59037 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00313P59037 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00313P59037 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00313P59037 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00313P59037 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms