Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FAM3BP58499 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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FAM3BP58499 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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