Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTCP1P56278 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms