Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP7P55210 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP7P55210 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP7P55210 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP7P55210 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP7P55210 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP7P55210 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP7P55210 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP7P55210 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP7P55210 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP7P55210 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP7P55210 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP7P55210 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP7P55210 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP7P55210 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP7P55210 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP7P55210 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP7P55210 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP7P55210 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP7P55210 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP7P55210 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP7P55210 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP7P55210 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP7P55210 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP7P55210 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP7P55210 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP7P55210 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP7P55210 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP7P55210 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP7P55210 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP7P55210 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP7P55210 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP7P55210 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP7P55210 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP7P55210 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP7P55210 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP7P55210 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP7P55210 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP7P55210 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP7P55210 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP7P55210 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP7P55210 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP7P55210 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP7P55210 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP7P55210 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP7P55210 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP7P55210 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP7P55210 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms