Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELLP55199 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELLP55199 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELLP55199 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELLP55199 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELLP55199 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELLP55199 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELLP55199 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELLP55199 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELLP55199 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELLP55199 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELLP55199 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELLP55199 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELLP55199 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELLP55199 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELLP55199 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELLP55199 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELLP55199 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELLP55199 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELLP55199 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELLP55199 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELLP55199 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ELLP55199 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELLP55199 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELLP55199 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ELLP55199 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELLP55199 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms