Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms