Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACLYP53396 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACLYP53396 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACLYP53396 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACLYP53396 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACLYP53396 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACLYP53396 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACLYP53396 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACLYP53396 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACLYP53396 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACLYP53396 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACLYP53396 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACLYP53396 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACLYP53396 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACLYP53396 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACLYP53396 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACLYP53396 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACLYP53396 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACLYP53396 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACLYP53396 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACLYP53396 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACLYP53396 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACLYP53396 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms