Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP5P51878 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP5P51878 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP5P51878 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP5P51878 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP5P51878 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP5P51878 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP5P51878 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP5P51878 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP5P51878 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP5P51878 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP5P51878 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP5P51878 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP5P51878 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP5P51878 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP5P51878 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP5P51878 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP5P51878 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP5P51878 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP5P51878 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP5P51878 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP5P51878 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP5P51878 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP5P51878 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP5P51878 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP5P51878 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP5P51878 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP5P51878 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASP5P51878 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP5P51878 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP5P51878 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP5P51878 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP5P51878 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP5P51878 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP5P51878 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP5P51878 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP5P51878 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP5P51878 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP5P51878 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms