Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP11P51784 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP11P51784 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP11P51784 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP11P51784 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP11P51784 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP11P51784 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP11P51784 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms