Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRCA2P51587 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms