Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms