Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPT1P50897 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPT1P50897 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPT1P50897 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPT1P50897 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPT1P50897 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPT1P50897 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPT1P50897 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPT1P50897 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPT1P50897 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPT1P50897 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPT1P50897 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPT1P50897 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPT1P50897 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPT1P50897 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPT1P50897 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPT1P50897 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPT1P50897 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms