Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAMP50895 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAMP50895 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAMP50895 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAMP50895 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAMP50895 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAMP50895 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAMP50895 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAMP50895 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAMP50895 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAMP50895 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAMP50895 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAMP50895 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCAMP50895 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAMP50895 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAMP50895 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAMP50895 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAMP50895 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAMP50895 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAMP50895 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAMP50895 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAMP50895 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAMP50895 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAMP50895 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAMP50895 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BCAMP50895 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCAMP50895 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BCAMP50895 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCAMP50895 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BCAMP50895 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BCAMP50895 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BCAMP50895 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
BCAMP50895 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
BCAMP50895 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCAMP50895 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BCAMP50895 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCAMP50895 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCAMP50895 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCAMP50895 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCAMP50895 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BCAMP50895 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCAMP50895 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAMP50895 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAMP50895 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAMP50895 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAMP50895 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAMP50895 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAMP50895 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAMP50895 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAMP50895 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAMP50895 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAMP50895 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAMP50895 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAMP50895 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAMP50895 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAMP50895 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAMP50895 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAMP50895 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAMP50895 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAMP50895 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAMP50895 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms