Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP2P50120 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RBP2P50120 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBP2P50120 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP2P50120 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RBP2P50120 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RBP2P50120 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RBP2P50120 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBP2P50120 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBP2P50120 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBP2P50120 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBP2P50120 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBP2P50120 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBP2P50120 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBP2P50120 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBP2P50120 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBP2P50120 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBP2P50120 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms