Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms