Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME1P48163 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME1P48163 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ME1P48163 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME1P48163 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ME1P48163 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ME1P48163 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME1P48163 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME1P48163 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME1P48163 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME1P48163 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME1P48163 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME1P48163 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME1P48163 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME1P48163 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME1P48163 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME1P48163 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME1P48163 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME1P48163 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME1P48163 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME1P48163 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME1P48163 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME1P48163 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME1P48163 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME1P48163 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME1P48163 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME1P48163 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ME1P48163 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME1P48163 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ME1P48163 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ME1P48163 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ME1P48163 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ME1P48163 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ME1P48163 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ME1P48163 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ME1P48163 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ME1P48163 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME1P48163 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ME1P48163 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME1P48163 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME1P48163 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME1P48163 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME1P48163 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME1P48163 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME1P48163 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME1P48163 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME1P48163 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms