Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP5P45974 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP5P45974 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP5P45974 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP5P45974 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP5P45974 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP5P45974 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP5P45974 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP5P45974 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP5P45974 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP5P45974 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP5P45974 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP5P45974 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP5P45974 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP5P45974 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP5P45974 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP5P45974 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP5P45974 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP5P45974 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP5P45974 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP5P45974 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP5P45974 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP5P45974 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP5P45974 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP5P45974 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP5P45974 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP5P45974 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP5P45974 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP5P45974 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP5P45974 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP5P45974 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP5P45974 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP5P45974 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP5P45974 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP5P45974 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP5P45974 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP5P45974 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP5P45974 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP5P45974 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP5P45974 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms