Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NKX2-1P43699 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms